二氧化碳培养箱温度加热方式一般分为水套式和气套式；水套式适合实验环境不太稳定，如有用电限制或者经常停电的用户选择；气套式特备有利于短期培养以及需要箱门频繁开关取放样的培养。
此外对于使用者来说气套式设计比水套式更加简单化，水套式需要对水箱进行加水、清空和清洗，要经常监控水箱运作的情况，还潜在污染隐患。
可靠的温控系统是培养箱*的一个重要部分，用户应选用高度的温度传感器并且具备相互地理多重温度控制功能的二氧化碳培养箱。同时在选择气套式培养箱时，培养箱内应该要装有风扇保证箱内的空气循环和流通。